Kdysi jsem potřeboval ve Windows naskriptovat trochu složitější zálohování. Po marných pokusech řešit to prostředky Windows jsem tam nainstaloval PHP a udělal jsem to v něm. Není to ideální, ale řešení to je
Šifrování je absolutní nutnost a pomáhá chránit před nekalými živly
Jasně, už jsem použil i cygwin, abych mohl automatizovat. Ale nikdy mne ještě nezklamal perl (win verze z www.activestate.com). Takže já bych na to šel pomocí kombinace perl+nerocmd. Ovšem podmínkou je možnost ovládání zálohovaných aplikací (např. exporty dat) z příkazové řádky, což není samozřejmost.