abclinuxu.cz AbcLinuxu.cz itbiz.cz ITBiz.cz HDmag.cz HDmag.cz abcprace.cz AbcPráce.cz
AbcLinuxu hledá autory!
Inzerujte na AbcPráce.cz od 950 Kč
Rozšířené hledání
×
včera 21:45 | Zajímavý projekt

Humble Bundle v rámci akce Double Fine Presents nabízí skupinu multiplatformních her bez DRM za vlastní cenu: Mountain, 140 a THOTH (jako jediná nikoliv pro Linux), za nadprůměrnou cenu navíc GNOG a Escape Goat 2 a za aspoň $10 Gang Beasts a Everything. Platbu lze rozdělit mezi vývojáře, Humble Bundle a charitu. Akce probíhá do 29. ledna.

Fluttershy, yay! | Komentářů: 2
včera 17:22 | Nová verze

Laboratoře CZ.NIC vydaly novou verzi 4.12.0 aplikace Datovka, tj. svobodné multiplatformní desktopové aplikace pro přístup k datovým schránkám a k trvalému uchovávání datových zpráv v lokální databázi.

Ladislav Hagara | Komentářů: 0
včera 17:00 | IT novinky

Byla zveřejněna pravidla hackerské soutěže Pwn2Own Vancouver 2019, jež proběhne od 20. do 22. března v rámci bezpečnostní konference CanSecWes. Vedle virtualizačních softwarů nebo webových prohlížečů se bude letos útočit i na automobil Tesla Model 3.

Ladislav Hagara | Komentářů: 0
včera 10:33 | Bezpečnostní upozornění

Byly zveřejněny informace o bezpečnostních chybách v scp klientech. Jedná se o chyby CVE-2019-6111, CVE-2018-20685, CVE-2019-6109 a CVE-2019-6110 v scp z OpenSSH a CVE-2018-20684 ve WinSCP. Zranitelné je také pscp z PuTTY. Server pod kontrolou útočníka může provádět neoprávněné operace na straně klienta.

Ladislav Hagara | Komentářů: 1
včera 09:44 | Komunita

Mozilla.cz informuje, že Firefox letos vypne Flash. Stane se tak s verzí 69. Podpora Flashe oficiálně skončí na konci roku 2020.

Ladislav Hagara | Komentářů: 3
včera 01:22 | Nová verze

Android Studio (Wikipedie), tj. oficiální integrované vývojové prostředí pro vývoj aplikací pro mobilní operační systém Android, bylo vydáno v nové stabilní verzi 3.3. Přehled novinek i s náhledy v oficiálním oznámení a také na YouTube.

Ladislav Hagara | Komentářů: 0
14.1. 16:22 | Komunita

O víkendu byl spuštěn proces zmrazování Debianu 10 s kódovým jménem Buster. Vybráno bylo výchozí grafické téma pro Buster. Je jím futurePrototype.

Ladislav Hagara | Komentářů: 7
13.1. 23:22 | Pozvánky

Spolek OpenAlt zve příznivce otevřených řešení a přístupu na 160. brněnský sraz, který proběhne v pátek 18. ledna od 18:00 v baru, galerii a kavárně MorsArt na Rooseveltově 6. Sraz je koncipován jako Linux Install Fest. Pořadatelé pomohou nováčkům s instalací a řešením problémů.

Ladislav Hagara | Komentářů: 0
11.1. 23:33 | Komunita

V říjnu byla změněna licence u multiplatformní dokumentové databáze MongoDB z GNU AGPLv3 na SSPL (Server Side Public License). Ten, kdo nabízí službu postavenou na MongoDB, musí nově poskytovat zdrojové kódy této služby nebo si může zakoupit proprietární licence. Pravděpodobně v reakci na to Amazon ve středu představil svou vlastní proprietární službu Amazon DocumentDB kompatibilní s MongoDB 3.6 API.

Ladislav Hagara | Komentářů: 1
11.1. 20:11 | Nová verze

Byla vydána nová major verze 5.0 frameworku pro testování počítačové bezpečnosti Metasploit (Wikipedie). Přehled novinek v příspěvku na blogu.

Ladislav Hagara | Komentářů: 0
Používáte USB Type-C?
 (19%)
 (16%)
 (10%)
 (12%)
 (36%)
 (3%)
 (46%)
Celkem 353 hlasů
 Komentářů: 0
Rozcestník

Dotaz: jak nahrát stovky souborů do databáze

4.9.2018 09:44 urputnik
jak nahrát stovky souborů do databáze
Přečteno: 1300×
Mám mnoho textových souborů, které budu potřebovat často prohledávat na základě zadaného regulárního výrazu. Rozhodl jsem se použít databázi. Slibuji si od toho, že prohledávání bude rychlejší než při použití ripgrepu. Zatím netuším jak efektivně nahrát stovky textových souborů do MySQL databáze z příkazového řádku nebo v shellu. Poradíte?

Odpovědi

4.9.2018 09:59 debian+
Rozbalit Rozbalit vše Re: jak nahrát stovky souborů do databáze
To som nedavno riesil :D ... Mal som 1 priecinok a v nom takmer 2 milion priecinkov s asi 1 suborom v kazdom priecinku.

Len generovanie SQL dotazu trvalo 24-48 hodin (povodne malo 2-3 tyzdne v cistom).

Ako na to.

Musis manualne nahodit data. Zo suborov vytvor jeden dotaz (alebo n dotazov, kde v kazdom dotaze vkladas 10000 insertov - aspon tak u mna to bolo). A tie potom hodis do databazy. Ak sa zmesti cele do ram, ukladaj do /dev/shm a vystup si skopiruj (kukni df pre /dev/shm). Alebo ukladaj na disk, ale generuj docastne do /dev/shm a po 100 napr. vkladani, z /dev/shm to uloz do na disk.

Tabulku si vytvor v phpmyadmin (instalacnu verziu pouzi zo stranky - v debian testing my bola blba). Vloz 2 insert, aby si videl syntax pre insert viac-vkladanim naraz.

A logiku si naprogramuj v php (ma funkciu mysqli_real_escape_string() na spravne konvertovanie na vkladanie). Php je ma aj prebrate syntax z bash.

Ak zaplatis, do 0.5 - 1 hodiny to mas. Ak mozes poslat tie data, dak Ti mozem rovno vytvorit jeden sql prikaz, ktory Ti rovno nahodi databazu. A poslat aj s programom, ktory pri tom vytvorim (ak do buducna ak by si potrebol si pridat).
4.9.2018 10:07 debian+
Rozbalit Rozbalit vše Re: jak nahrát stovky souborů do databáze
Ak sa zmestia do RAM, pouzi ramFS. /dev/shm je nim.
6.9.2018 15:20 lazywriter
Rozbalit Rozbalit vše Re: jak nahrát stovky souborů do databáze
Jelikož se zmiňuje SQL, tak se nejspíš předpokládá _relační_ databáze. A ta má takový název proto, že dobře řeší vztahy (cizím slovem relace) mezi záznamy. Takže není dobrý nápad ji znasilňovat na něco jiného. Když už nestačí doporučené hledání na disku, tak by mohly připadat do úvahy nějaké databáze, ale rozhodně ne relační. Napadá mě třeba nějaká dokumentová nosql databáze, např. Elasticsearch apod.
6.9.2018 15:21 lazywriter
Rozbalit Rozbalit vše Re: jak nahrát stovky souborů do databáze
pardon, ukliknutí. Odpověď měla jít přímo na původní otázku.
6.9.2018 17:28 Kit | skóre: 42 | Brno
Rozbalit Rozbalit vše Re: jak nahrát stovky souborů do databáze
Relace je ten jeden záznam (n-tice) v tabulce.
Komentáře označují místa, kde programátor udělal chybu nebo něco nedodělal.
7.9.2018 10:09 lazywriter
Rozbalit Rozbalit vše Re: jak nahrát stovky souborů do databáze
Použít třeba Google přece není tak složité. Druhý odkaz na dotaz "relace databáze": https://office.lasakovi.com/access/tabulky/relace-vazby-v-databazich-teorie/

Záznam se v relační teorii jmenuje entita. Proto se také schématu databáze někdy říká ER diagram od slov entita-relace (česky: záznam a jeho vztah k ostatním).
4.9.2018 10:00 Aleš Kapica | skóre: 48 | blog: kenyho_stesky | Ostrava
Rozbalit Rozbalit vše Re: jak nahrát stovky souborů do databáze
A nebylo by lepší místo takové opičárny vyzkoušet sift?
4.9.2018 10:04 debian+
Rozbalit Rozbalit vše Re: jak nahrát stovky souborů do databáze
Ako to testovali/merali, lebo HDD a ani SD disk neda 30GB za 0.5s.

Vid "Web log files search"
4.9.2018 10:10 Aleš Kapica | skóre: 48 | blog: kenyho_stesky | Ostrava
Rozbalit Rozbalit vše Re: jak nahrát stovky souborů do databáze
Nevím jak to testovali oni, ale pokud bych chtěl obejít IO omezení HDD, tak bych ty data hodil do ramdisku.

Jinak tazatel chce prohledávat stovky textových souborů. To je úplná sranda proti prohledávání milionů malých souborů. Neuvedl taky co s tím pak chce dělat. Já si většinou takový soubor chci přečíst, proto je pro mne optimální klasická kombinace grep + less. A pokud bych chtěl něco svižnějšího, tak bych nejspíš vyzkoušel ten sift. Pořád mi to přijde lepší než se drbat s nějakou databází. Bez rozumné indexace to stejně nedává smysl.
4.9.2018 10:55 Aleš Kapica | skóre: 48 | blog: kenyho_stesky | Ostrava
Rozbalit Rozbalit vše Re: jak nahrát stovky souborů do databáze
Tak jsem to jen tak z legrace zkusil na svůj home. Obsahuje aktuálně 1044971 souborů (208GB). Co se mi líbilo, tj. že sift zvýrazňoval barevně cestu k souboru a nalezený vzorek. Sift také na rozdíl od grepu jel vícevláknově.

Co jsem neošetřil, to bylo nastavení parametru aby nepřeskakoval příliš dlouhé řádky, takže 3130 souborů sift právě kvůli tomu přeskočil.
sift
real    17m12,227s
user    2m28,896s
sys     4m6,882s

grep
real    23m28,636s
user    3m38,805s
sys     3m57,037s
4.9.2018 12:27 urputnik
Rozbalit Rozbalit vše Re: jak nahrát stovky souborů do databáze
Tedy by mě zajímalo porovnání s prohledáváním v DB, ale to asi vyzkoušet nemůžete.
4.9.2018 13:09 dustin | skóre: 62 | blog: dustin
Rozbalit Rozbalit vše Re: jak nahrát stovky souborů do databáze
Nahrání do DB a indexace pro nějaký fulltext (který nezafunguje na regexp) je dost náročná operace. Samozřejmě pokud budeš hledat častěji (a bude možné použít nějaký index), přínos to mít může. Jinak bude varianta s mezikrokem do DB logicky delší, když dělá to samé a ještě mnoho navíc.
4.9.2018 16:03 lertimir | skóre: 62 | blog: Par_slov
Rozbalit Rozbalit vše Re: jak nahrát stovky souborů do databáze
Ano, souhlas. Podstatné je, že fultext index je sice mnohonásobně rychlejší, ale v podstatě je uvnitř jenom něco jako ekvivalent substringu. rozhodně to není regexp.
4.9.2018 10:20 Kit | skóre: 42 | Brno
Rozbalit Rozbalit vše Re: jak nahrát stovky souborů do databáze
Pokud ta data v souborech nejsou strukturována, tak ti konverze do databáze moc fungovat nebude a ztratíš pohodlí přímé editace. Jak dlouho tomu ripgrepu trvá, než nalezne výskyty vzorku?
Komentáře označují místa, kde programátor udělal chybu nebo něco nedodělal.
4.9.2018 11:04 urputnik
Rozbalit Rozbalit vše Re: jak nahrát stovky souborů do databáze
Strukturovana jsou, ale to bych v te db uz nejak vyresil. Treba tak, ze bych si cestu do adresare (strukturu) ukladal do tabulky vedle toho textu.

Rychle to s tim ripgrepem je zatim dost, ale mam tech souboru jenom asi stovku. Brzy jich budou tisice.
4.9.2018 11:10 debian+
Rozbalit Rozbalit vše Re: jak nahrát stovky souborů do databáze
Strukturovana jsou, ale to bych v te db uz nejak vyresil. Treba tak, ze bych si cestu do adresare (strukturu) ukladal do tabulky vedle toho textu.
To v ziadnom pripade!!!! ... Zvlast tabulka na nazvy a zvlast na data. A prepajas indexami.
4.9.2018 11:22 Kit | skóre: 42 | Brno
Rozbalit Rozbalit vše Re: jak nahrát stovky souborů do databáze
Je u všech souborů zachována stejná struktura sloupců nebo to má každý soubor jinak? Máš ty soubory v CSV nebo v jiném podobném formátu?
Komentáře označují místa, kde programátor udělal chybu nebo něco nedodělal.
4.9.2018 12:23 urputnik
Rozbalit Rozbalit vše Re: jak nahrát stovky souborů do databáze
Je to jen text, žádný formát to nemá.
4.9.2018 12:51 Kit | skóre: 42 | Brno
Rozbalit Rozbalit vše Re: jak nahrát stovky souborů do databáze
V tom případě nedává moc smysl takové nestrukturované údaje ukládat do databáze. Jak velké jsou ty soubory a co od toho databázového řešení očekáváš?
Komentáře označují místa, kde programátor udělal chybu nebo něco nedodělal.
Mark Stopka avatar 4.9.2018 13:32 Mark Stopka | skóre: 58 | blog: Paranoidní blog | European Economic Area
Rozbalit Rozbalit vše Re: jak nahrát stovky souborů do databáze
On ElasticSearch je taky databáze, víme? :-)
4.9.2018 13:46 urputnik
Rozbalit Rozbalit vše Re: jak nahrát stovky souborů do databáze
V podstatě jde o to, jestli webový backend bude pracovat se strukturou souborů nebo s databází, ze které by se posléze vybraný text kopíroval do souboru, se kterým by se pracovalo -- překlad textového formátu do PDF a jiných formátů. Dneska už je běžné mít všechno v DB, je to rychlé a pohodlné a dobře rozšiřitelné. Na základě toho mě právě napadlo hrnout už to všechno přes DB, protože ta tam bude stejně, zejména pokud by to vyhledávání v DB mělo být rychlejší.
4.9.2018 14:23 dustin | skóre: 62 | blog: dustin
Rozbalit Rozbalit vše Re: jak nahrát stovky souborů do databáze
Nepřijde mi, že je dnes běžné mít všechno v DB. Je to vždy o konkrétních potřebách.

Pokud potřebuješ fulltext (ne regexpy, které zmiňuješ), pak to nahraj do elasticsearche, jak tady již bylo řečeno. Nevím o DB indexu, který by uměl urychlit obecný regexp.

Mysql žádný pořádný fulltext nemá, navíc s podporou různých jazyků.

Nebo použij Postgresql https://postgres.cz/wiki/Instalace_PostgreSQL#Instalace_Fulltextu
Josef Kufner avatar 7.9.2018 11:11 Josef Kufner | skóre: 68
Rozbalit Rozbalit vše Re: jak nahrát stovky souborů do databáze
To, co chceš, je hlavně index. Pro obecné regexpy se indexovat nedá, ale pokud máš předem dané dotazy a přepíšeš je do jednoduchého hledání klíčových slov, tak už to půjde fulltextem.

Na fulltext můžeš zkusit třeba Sphinx Search nebo již zmiňovaný Elastic Search. Fulltext v MySQL je dosti omezený.

Import do databáze uděláš tak, že si napíšeš skript, který přečte soubor, sestaví SQL dotaz a pošle to do databáze. Je to na pár řádků. Doporučuju sáhnout po rozumném skriptovacím jazyce, např. Python nebo PHP. V shellu se z toho zblázníš.
Hello world ! Segmentation fault (core dumped)

Založit nové vláknoNahoru

Tiskni Sdílej: Linkuj Jaggni to Vybrali.sme.sk Google Del.icio.us Facebook

ISSN 1214-1267   www.czech-server.cz
© 1999-2015 Nitemedia s. r. o. Všechna práva vyhrazena.