Takze když přes apt stáhnu balíčky, které automaticky nainstaluje rpm, používám oboje...

Tak to tedy ne. Každý, kdo používá yum nebo urpmi, má vybrat rpm, jelikož yum a urpmi nejsou systémy správy balíčků, na které se anketa ptá.

Systém správy balíčků je věc, kterou můžeš mít v systému používajcím balíčky právě jednu (pokud nejsi naprostý šílenec). Je to věc, která dokáže nainstalovat, odinstalovat, upgradovat balíčky, udržuje si databázi o instalovaném software. Možnosti by zde byly: dpkg (který tam vůbec není!), rpm, portage, pkgtool[1].

Druhá vrstva je ,middleware` -- napsal jsem původně frontendy, protože technicky to frontendy jsou, ale přece jen se liší od třetí vrstvy[3]. To je apt, urpmi, yum, up2date, swaret, ... Přidává schopnost pracovat se zdroji balíčků (repositáři) a automaticky řešit závislosti, protože to nebývá inherentní vlasnost klasických systémů správy balíčků. Nad jedním systémem správy balíčků jich může používat zároveň několik (ovšem se stejnými zdroji, jinak bude automatické řešení závislostí provádět hrozné věci).

Poslední vrstva jsou opravdové frontendy: synaptic, gyum, dselect, ..., a všechna ta klikátka, co ani nevím, jak se jmenují. Můžeš jich mít nainstalovaných a používat, kolik se ti zlíbí. Oproti předchozí vrstvě přidávají jen visualizaci a uživatelský komfort.

[1] Asi; já nevím, jestli se ta věc ve Slackovi nějak souhrnně jmenuje.

[2] Byť hranice nejsou tak jasné jako mezi první a ostatními -- např. yast je asi obojí.

Tgz je náhodou super Vlastní balíčky se tvoří snadno, pracuje se s tím jednoduše a nic moc to neumí. Je fakt, že po vyzkoušení BSD portů mám jisté pochyby, ale názor (ještě) neměním