Dotaz: scipy chce jinou verzi numpy

[mák]

Mám čerstvě nainstalované Ubuntu 24.04.3, je nainstalovaný python3, numpy i scipy s balíčků Ubuntu. S knihovnou numpy je to v pořádku, ale scipy nelze importovat, hlásí:

UserWarning: A NumPy version >=1.21.6 and <1.28.0 is required for this version of SciPy (detected version 2.3.2)

Potřeboval bych buď nahrát správnou verzi numpy a nebo scipy, tak aby požadavek byl splněn.

Na internetu jsem našel doporučení nainstalovat virtuální prostředí (vent), bohužel toto prostředí se musí po každém zapnutí počítače znovu aktivovat a navíc systém stejně scipy nevidí. Je dostupná pouze v tomto virtuálním prostředí.

Potřeboval bych co nejjednodušší řešení abych knihovnu scipy viděl bez nějakých složitostí.

Odpovědi

[mák]

Za opakovaný dotaz se omlouvám, systém psal červeně o tom že neproběhlo ověření, tak jsem myslel, že to nebylo odesláno. Ale jak je vidět tak se to odeslalo i bez ověření, které se nezobrazilo.

[Marek]

Virtual environments

pip install specific version of a package

[Marek]

Ad. najjednoduchsia cesta ...

Vytvorit virtualne prostredie:

python3 -m venv <new_scipy_env_dir>

napr.

python3 -m venv scipy_env

Aktivovat virtualne prostredie (Bash shell):

source <new_scipy_env_dir>/bin/activate

napr.

source scipy_env/bin/activate

Instalovat ciste scipy, ktore si dotiahne potrebne zavislosti:

pip install scipy

Na konci prace, deaktivovat virtualne prostredie:

source <new_scipy_env_dir>/bin/deactivate

Pre opatovnu pracu, staci len aktivovat/deaktivovat virtualne prostredie.

[Mák]

Ano, to jsem zkoušel, bohužel scipy funguje pouze v tomto virtuálním prostředí. Pokud spustím program mimo toto prostředí pak toto nové scipy není videt. A píše mi tu výše uvedenou hlášku. Takže instalace virtuálu není řešením.

Jedná se mi o python makra v libreoffice Calc, které jsou umístěný v přesně definovaném adresáři. Je jich hodně a nechci je přepisovat, když na předcházející verzi Ubuntu fungovaly.

Nevím jestli je možné aby se požadavky na načtení scipy přesměrovaly do tohoto virtuálního prostředí, ale bez úpravy python maker.

[Marek]

Jedine co robi activate, je, ze meni PATH, VIRTUAL_ENV a modifikuje bash prompt.

Skusal ste volat libreoffice calc priamo z konzoly?

Teda, po aktivacii virtualneho prostredia v konzole:

<libreofficecalc_exe>

(Neviem presnu cestu, mam len konzolove ubuntu.)

Pripadne, bez aktivacie prostredia:

PATH=<cesta_k_bin_vo_venv>:$PATH <libreofficecalc_exe>

alebo este s VIRTUAL_ENV

PATH=<cesta_k_bin_vo_venv>:$PATH VIRTUAL_ENV=<cesta_k_bin_vo_venv> <libreofficecalc_exe>

[Marek]

Opravy:

1) PATH=<cesta_k_bin_vo_venv>:$PATH VIRTUAL_ENV=<cesta_k_scipy_venv> <libreofficecalc_exe>

2) deactivate sa vola priamo z aktivovaneho prostredia (je to funkcia definovana v activate skripte), nie je to samostatny skript ako napr. vo Windows.

[mák]

Takže libreoffice když spustím z terminálu, pak se chová stejně (scipy hlásí špatnou verzi a nejde import), numpy funguje. Pokud spustím libreoffice s prostředí venv, pak nejde ani scipy a ani numpy. Asi je to nějak izoluje.

Nejlepší by bylo asi nainstalovat starší verzi numpy (mám 2.3.2 a potřebuji >=1.21.6 and <1.28.0).

[mak]

Zkoušel jsem přeinstalovat Python včetně numpy a scipy a všiml jsem si, že scipy je verze 1.11.4-6 což odpovídá tomu jak se hlásí. Ale numpy se v Synapticu hlásí jako 1.26.4+ což by mělo být v pořádku.

Ale pokud dám dotaz: python3 -c "import numpy; print(numpy.__version__)" tak se mi vrátí verze 2.3.2, což je divný.

Ve virtuálním prostředí je scipy verze 1.16.1 a numpy 2.3.2. Verze numpy ve virtuálním prostředí je stejné jako ve zbytku počítače. To budu muset nějak odstranit.

Zkusil jsem ještě libreoffice a tam to hlásí verzi numpy 2.2.6, takže asi používá svoji vlastní verzi. Scipy není dostupná, takže verzi nezjistím. Pravděpodobně toto libreoffice co mám nainstalované, nemá vůbec zakomponovanou knihovnu scipy.

[mak]

Tak jsem vyřešil Python v Libreoffice tak, že jsem nainstaloval doplněk LibrePythonista. Který mi doinstaloval scipy do LibreOffice. Tím je potvrzeno že LibreOffice (numpy 2.2.6, scipy 1.15.3) používá jiný Python než zbytek systému (numpy 2.3.2, scipy 1.11.4).

Teď ještě zbývá vyřešit nesoulad verzí scipy/numpy, ale to není tak důležité, protože tohle řeší virtuální prostředí (numpy 2.3.2, scipy 1.16.1), kde to funguje dobře.

Takže za mě asi vyřešeno.