Dotaz: Matlab v ArchLinuxu - nekonečný příběh

[Vtipnéř]

Všechny zdravím,

po updatu systému opět přestal fungovat Matlab, což se mi stává minimálně jednou za rok. Výjimečné je, že dříve nefungovalo jen něco, například editor, teď to zahlásí chybu a spadne hned po spuštění. V minulosti pomohlo hledání řešení na internetu a zkoumání závislostí knihoven pomocí ldd s následným nahrazením verzí z Matlabu verzemi systémovými - metoda pokus/omyl, ale nakonec jsem se zatím vždy dobral k řešení. V nynějším případě nepomohlo nic. Poslal jsem na podporu vygenerovaný crash_dump, odepsali mi, že to vypadá na neznámý problém.

Přikládám onen crash_dump a dávku, kterou Matlab pouštím, kdyby někoho něco napadlo, budu rád. V terminálovém režimu (option -nojvm) Matlab funguje.

Jirka

matlab.sh:

#!/bin/bash
export LD_PRELOAD=/usr/lib/libgcc_s.so.1:/usr/lib/libfreetype.so:/usr/lib/libstdc++.so.6:/usr/lib/libfontconfig.so:/usr/lib/libexpat.so.1:/usr/lib/libminizip.so:/usr/lib/libgfortran.so.5:/usr/lib/libquadmath.so.0
export JAVA_TOOL_OPTIONS='-Djogl.disable.openglarbcontext=1'
export GTK_PATH=/usr/lib/gtk-2.0
/home/user1/MATLAB/R2023b/bin/matlab $1 $2 $3

Crash_dump:

--------------------------------------------------------------------------------
          Segmentation violation detected at 2025-07-17 13:38:21 +0200
--------------------------------------------------------------------------------

Configuration:
  Crash Decoding           : Disabled - No sandbox or build area path
  Crash Mode               : continue (default)
  Default Encoding         : UTF-8
  Deployed                 : false
  Desktop Environment      : LXDE
  GNU C Library            : 2.41 stable
  Graphics Driver          : Uninitialized hardware 
  Graphics card 1          : 0x8086 ( 0x8086 ) 0xa16 Version 0.0.0.0 (0-0-0)
  Java Version             : Java 1.8.0_202-b08 with Oracle Corporation Java HotSpot(TM) 64-Bit Server VM mixed mode
  MATLAB Architecture      : glnxa64
  MATLAB Entitlement ID    : 677130
  MATLAB Root              : /home/user1/.matlab/MATLAB/R2023b
  MATLAB Version           : 23.2.0.2365128 (R2023b)
  OpenGL                   : hardware
  Operating System         : Linux 6.12.38-1-lts #1 SMP PREEMPT_DYNAMIC Mon, 14 Jul 2025 16:10:56 +0000 x86_64
  Process ID               : 10143
  Processor ID             : x86 Family 6 Model 69 Stepping 1, GenuineIntel
  Session Key              : 922724d9-8163-404b-833c-a9cca7f4610a
  Window System            : The X.Org Foundation (12101018), display :0.0

Fault Count: 1


Abnormal termination:
Segmentation violation

Current Thread: 'MCR 0 interpret' id 131475607385792

Register State (from fault):
  RAX = 0000000000000000  RBX = 0000000000000000
  RCX = 0000779418000ba0  RDX = 0000779418ab0120
  RSP = 000077938cdfbae0  RBP = 000000006c65746e
  RSI = 0000000000000005  RDI = 0000779418ab0040

   R8 = 0000000000000010   R9 = 0000000000000bf0
  R10 = 0000779418acc410  R11 = ffffffffffffff10
  R12 = 000000000000000b  R13 = 0000000000000000
  R14 = 0000000000000001  R15 = 0000779418772080

  RIP = 00007793ce212790  EFL = 0000000000010246

   CS = 0033   FS = 0000   GS = 0000

Stack Trace (from fault):
[  0] 0x00007793ce212790 /home/user1/.matlab/MATLAB/R2023b/bin/glnxa64/matlab_startup_plugins/lmgrimpl/libmwlmgrimpl.so+02172816 Ox76b599173db0bd16+00000400
[  1] 0x00007793ce2130a7 /home/user1/.matlab/MATLAB/R2023b/bin/glnxa64/matlab_startup_plugins/lmgrimpl/libmwlmgrimpl.so+02175143 lc_init+00000055
[  2] 0x00007793622646a8                           /usr/lib/libgnutls.so.30+00411304
[  3] 0x00007793622264ef                           /usr/lib/libgnutls.so.30+00156911
[  4] 0x000077946055b2f7                        /lib64/ld-linux-x86-64.so.2+00021239
[  5] 0x000077946055b3cd                        /lib64/ld-linux-x86-64.so.2+00021453
[  6] 0x00007794605584b5                        /lib64/ld-linux-x86-64.so.2+00009397 _dl_catch_exception+00000325
[  7] 0x00007794605620c9                        /lib64/ld-linux-x86-64.so.2+00049353
[  8] 0x0000779460558416                        /lib64/ld-linux-x86-64.so.2+00009238 _dl_catch_exception+00000166
[  9] 0x00007794605624de                        /lib64/ld-linux-x86-64.so.2+00050398
[ 10] 0x000077945eca1b34                                 /usr/lib/libc.so.6+00596788
[ 11] 0x0000779460558416                        /lib64/ld-linux-x86-64.so.2+00009238 _dl_catch_exception+00000166
[ 12] 0x0000779460558569                        /lib64/ld-linux-x86-64.so.2+00009577
[ 13] 0x000077945eca1623                                 /usr/lib/libc.so.6+00595491
[ 14] 0x000077945eca1beb                                 /usr/lib/libc.so.6+00596971 dlopen+00000107
[ 15] 0x00007793cef0e9e1 /home/user1/.matlab/MATLAB/R2023b/sys/java/jre/glnxa64/jre/lib/amd64/server/libjvm.so+09497057
[ 16] 0x00007793cecfc539 /home/user1/.matlab/MATLAB/R2023b/sys/java/jre/glnxa64/jre/lib/amd64/server/libjvm.so+07324985 JVM_LoadLibrary+00000153
[ 17] 0x00007793bae0e380 /home/user1/.matlab/MATLAB/R2023b/sys/java/jre/glnxa64/jre/lib/amd64/libjava.so+00058240 Java_java_lang_ClassLoader_00024NativeLibrary_load+00000416
[ 18] 0x00007793a50186c7                                   <unknown-module>+00000000
[ 19] 0x00007793a50082bd                                   <unknown-module>+00000000
[ 20] 0x00007793a5007a90                                   <unknown-module>+00000000
[ 21] 0x00007793a50082bd                                   <unknown-module>+00000000
[ 22] 0x00007793a50082bd                                   <unknown-module>+00000000
[ 23] 0x00007793a50082bd                                   <unknown-module>+00000000
[ 24] 0x00007793a50082bd                                   <unknown-module>+00000000
[ 25] 0x00007793a5008040                                   <unknown-module>+00000000
[ 26] 0x00007793a5008040                                   <unknown-module>+00000000
[ 27] 0x00007793a50082bd                                   <unknown-module>+00000000
[ 28] 0x00007793a50082bd                                   <unknown-module>+00000000
[ 29] 0x00007793a50082bd                                   <unknown-module>+00000000
[ 30] 0x00007793a50082bd                                   <unknown-module>+00000000
[ 31] 0x00007793a50082bd                                   <unknown-module>+00000000
[ 32] 0x00007793a5008114                                   <unknown-module>+00000000
[ 33] 0x00007793a5008040                                   <unknown-module>+00000000
[ 34] 0x00007793a5008040                                   <unknown-module>+00000000
[ 35] 0x00007793a5008040                                   <unknown-module>+00000000
[ 36] 0x00007793a5008040                                   <unknown-module>+00000000
[ 37] 0x00007793a5008040                                   <unknown-module>+00000000
[ 38] 0x00007793a50082bd                                   <unknown-module>+00000000
[ 39] 0x00007793a5008302                                   <unknown-module>+00000000
[ 40] 0x00007793a5008302                                   <unknown-module>+00000000
[ 41] 0x00007793a50082bd                                   <unknown-module>+00000000
[ 42] 0x00007793a50082bd                                   <unknown-module>+00000000
[ 43] 0x00007793a5008040                                   <unknown-module>+00000000
[ 44] 0x00007793a50007a7                                   <unknown-module>+00000000
[ 45] 0x00007793cec8839b /home/user1/.matlab/MATLAB/R2023b/sys/java/jre/glnxa64/jre/lib/amd64/server/libjvm.so+06849435
[ 46] 0x00007793ced005e4 /home/user1/.matlab/MATLAB/R2023b/sys/java/jre/glnxa64/jre/lib/amd64/server/libjvm.so+07341540 JVM_DoPrivileged+00001268
[ 47] 0x00007793a5390f95                                   <unknown-module>+00000000
[ 48] 0x00007793a57fa1f4                                   <unknown-module>+00000000
[ 49] 0x00007793a50082bd                                   <unknown-module>+00000000
[ 50] 0x00007793a50082bd                                   <unknown-module>+00000000
[ 51] 0x00007793a50082bd                                   <unknown-module>+00000000
[ 52] 0x00007793a50082bd                                   <unknown-module>+00000000
[ 53] 0x00007793a50007a7                                   <unknown-module>+00000000
[ 54] 0x00007793cec8839b /home/user1/.matlab/MATLAB/R2023b/sys/java/jre/glnxa64/jre/lib/amd64/server/libjvm.so+06849435
[ 55] 0x00007793cec85c63 /home/user1/.matlab/MATLAB/R2023b/sys/java/jre/glnxa64/jre/lib/amd64/server/libjvm.so+06839395
[ 56] 0x00007793cec86227 /home/user1/.matlab/MATLAB/R2023b/sys/java/jre/glnxa64/jre/lib/amd64/server/libjvm.so+06840871
[ 57] 0x00007793cecf239c /home/user1/.matlab/MATLAB/R2023b/sys/java/jre/glnxa64/jre/lib/amd64/server/libjvm.so+07283612
[ 58] 0x00007793cf07b9eb /home/user1/.matlab/MATLAB/R2023b/sys/java/jre/glnxa64/jre/lib/amd64/server/libjvm.so+10992107
[ 59] 0x00007793cf07bcf1 /home/user1/.matlab/MATLAB/R2023b/sys/java/jre/glnxa64/jre/lib/amd64/server/libjvm.so+10992881
[ 60] 0x00007793cef0d8c2 /home/user1/.matlab/MATLAB/R2023b/sys/java/jre/glnxa64/jre/lib/amd64/server/libjvm.so+09492674
[ 61] 0x000077945eca57eb                                 /usr/lib/libc.so.6+00612331
[ 62] 0x000077945ed2918c                                 /usr/lib/libc.so.6+01151372

---

---

Odpovědi

[X]

Provozujes to na nepodporovanem systemu, tvuj problem.

[Vtipnéř]

Provozujes to na nepodporovanem systemu, tvuj problem.

Tahle informace je pro mne stará nejmíň 10 let (možná 15). Něco novějšího by nebylo?

Jirka

[X]

Bylo, prechod na verzi R2025a.

[Vtipnéř]

Bylo, prechod na verzi R2025a.

Asi nechceš tvrdit, že ArchLinux je ve verzi 2025a podporovaný, že?

Jirka

[X]

Lol, co cekas? Ze zrovna kvuli tobe, bude nekdo debugovat soft, kterej ani nejses ochotnej provozovat na spravnem setupu? Das si vyfuk na skodovku do mercedesu a divis se, ze to nehraje? Vtipnėř, opravdu.

[Vtipnéř]

Lol, co cekas? Ze zrovna kvuli tobe, bude nekdo debugovat soft, kterej ani nejses ochotnej provozovat na spravnem setupu? Das si vyfuk na skodovku do mercedesu a divis se, ze to nehraje? Vtipnėř, opravdu.

Z Tvé odpovědi to vypadá, že se snažíš spíš prudit, něž radit, nicméně zkusím odpovědět normálně.

ArchLinux používám od roku 2010 a stojí mi za to se ho držet i přes nevýhody, které to přináší. Na nepodporovaném softwaru pracuju celkem běžně, například i u internetového bankovnictví. Matlab už jsem rozjel ve virtuálním Debianu, ale používám ho stále méně, protože na naší univerzitě je nejistá jeho další podpora. Proto se mi taky nechce přecházet na novou verzi. Takže pomalu přecházím na Octave, myslím, že současné problémy jen proces urychlí.

A taky si zkus zjistit, co znamená "vtipnéř".

Jirka

[X]

Matlab už jsem rozjel ve virtuálním Debianu

Vyreseno. Chces se drzet Archu, v pohode, ale umele problemy, ktere si vyrobis ->ty sam<-, by jsi si taky ->ty sam<- mel vyresit. To neni pruda.

[Vtipnéř]

Matlab už jsem rozjel ve virtuálním Debianu

Vyreseno. Chces se drzet Archu, v pohode, ale umele problemy, ktere si vyrobis ->ty sam<-, by jsi si taky ->ty sam<- mel vyresit. To neni pruda.

Některé problémy, které jsem měl dřív, jsem vyřešil tím, že jsem přešel na Arch. Myslím, že každá distribuce má klady a zápory. Ostatně s tou "správnou distribucí" to taky není úplně jisté, podobné problémy jako já měli občas i studenti s Windows, u nichž je podpora deklarována.

O tom, že Tvůj přístup ("Je to tvůj problém, tak si ho vyřeš.") není pruda, jsi mě nepřesvědčil.

Jirka

[X]

Ja jsem psal, ze je to umely problem, ktery jsi si vytvoril ty sam. Problem, ktery by vubec nemusel existovat.

Trvas na nestandartnim prostredi, kde ani vyrobce negarantuje funkcionalitu.

Proste to na Archu nejede, tak proc se trapit? To mi fakt vysvetli.

[Vtipnéř]

Proste to na Archu nejede, tak proc se trapit? To mi fakt vysvetli.

Protože výhody převažují. Jak už jsem psal v předchozí odpovědi, některé problémy jsem vyřešil právě přechodem na Arch.

Další rozpravu o tom, proč používám ArchLinux považuji za zbytečnou.

Jirka

[Peter Golis]

některé problémy jsem vyřešil právě přechodem na Arch

Obvykle sa jedná o problém s programovým vybavením ktoré je v doplnkových repozitároch. Za funkcionalitu takého SW nezodpovedá ekosystém okolo tvorcov/správcov distribúcie, ale zodpovedá zaň tvorca alebo správca daných programov.

Rovnako by si pochodil pri prechode na hociktorú inú distribúciu SW typu Rolling Forward. Namiesto Arch by pomohlo napr. aj Gentoo, alebo prejsť z repozitárov na snap alebo appimage. Budeš mať novší SW, niečo ti pôjde lepšie, ale niekedy ti ta niečo tak isto zblbne.

Keby bol Arch spásou, tak by ho podporovali aj výrobcovia SW na ktorý sa pýtaš.

[hmmmw]

Že chce rozjet něco na běžné distribuci, která není přímo podporována výrobcem se musím tazatele zastat. Tato poradna je přesně na takové dotazy. Co všechny ty situace, kdy výrobce HW nepodporuje linux, a tady se to řeší. To sem také nepatří?

[X]

To neco, je uzavreny komercni software..

[hmmmw]

No a? Když chceš rozjet Nvidiu, tak to taky není žáden OSHW, a dotazy na konfiguraci pod linuxem jsou ok. Dotaz tady patří, a pokud se ti nelíbí, měl jsi jej místo rýpání prostě ignorovat.

[Max]

To vypadá jako pád samotné javy. Podle support matrixu by měl Matlab 2023b podporovat OpenJDK 11. Zkus nainstalovat OpenJDK 11 v rámci ArchLinux a použít javu z OS.
Případně zkusit Matlab R2025a a OpenJDK 11 nebo 17 nebo 21. Bundlovanou javu, co je u Matlabu, bych nepoužíval, když ta ofiko podpora OpenJDK je.
Zdar Max

[Vtipnéř]

Díky za tip, teď chybu nehlásí Matlab, ale Java, nicméně je to posun. Momentálně nemám čas to řešit, dostanu se k tomu asi až v pondělí.

Jirka

[Vtipnéř]

Měl jsem stejný crash. Nastalo to po updatu gnutls. Prozatimní řešení je stáhnout gnutls-3.8.9-1 a spouštět to s nimi.

[Vtipnéř]

Díky, pomohlo to.

Jirka

[Olaf]

Já Matlab moc nemusel, dělal jsem většinou s CASy (Mathematica, Maple, Sage Math). U některých kolegů, co se zabývali numerikou, jsem pozoroval přesun z Matlabu na Scilab/Octave.

Pokud je potřeba zachovat Matlab, což tak jej spouštět přes Distrobox? Pro mě určitě lepší řešení než spouštět virtuální stroj. Tedy zvolit v něm podporovanou distribuci. Ostatně je to doporučený postup na fóru Matlabu, jak se teď dívám. :)

[Vtipnéř]

Už jsem to psal předtím, taky přecházím na Octave, postupně převádím výukové materiály a Matlab od verze 2023b umí převod svých LiveScriptů na formát Jupyter Notebook.

Jirka

[Olaf]

Aha, tak ok. :) Ten Distrobox je ale pěkná věc. BTW, mohl bych se na ty výukové materiály podívat? Jsem zvědavý. :) Jo, Jupyter s podporou mnoha jader je super. I když teď často sahám k notebooku Marimo.

[Vtipnéř]

Díky za tipy, mrknu se na to.

Ty výukové materiály se týkají numerické matematiky, jestli chceš, napiš mimo diskusní fórum, pošlu Ti link.

Jirka